描述因为一次飞机意外，大雄、多啦A梦等人进入另一时空“鸟托邦”，大家和鸟人古斯基、猫头鹰博士成为好友，不过鸟人警备队长企图征服人类，古斯基在大雄协助下，成功拯救鸟托邦和人类。 因为环境遭受破坏,导致企鹅、黑面皮鹭等鸟类临绝种的命运,这些现象在地球上已成了不容忽视地问题。看了这个新闻的大雄突发奇想,幻想一些长得像鸟类的外层空间人拯救了鸟类,结果遭到胖虎及小夫的取笑。但是听王聪明说到世界上真的有鸟驱人身的鸟人传说后,大雄一直沉尽在天空飞行的异想世界里...他开始参考百科全书,试着自己做翅膀想要在天空飞翔,结果当然不断的失败.... 一天,当大雄正在练习飞行时,突然从天空掉下了一飞行器有着鸟驱人身的不明生物,跟大雄撞在一起。大家匆匆忙忙跑向那个不明生物掉落的地方一看,发现他就是传说中鸟世界得人类库斯可。因为与大雄相撞,库斯可受了点伤,哆啦A梦们担心如果被人类发现库斯可的存在,会造成大骚动,于是便将库斯可安置在「鸟巢式露营小屋」,并开始修理他的飞行器。在好不容易修好飞行器,正准备试飞当时,胖虎和小夫紧抓着飞行器偷偷搭上去了,因为乘坐的人太多,可能会导致飞行器墬落,因此哆啦A梦一行人只好戴上竹蜻蜓追上去。就在当时,突然天空打开了一个大洞穴,所有人都被吸了进去了！他们所前往的世界正是有传说中的鸟世界-巴德比亚。映入眼帘的净是有着人身的鸟类们......